โรคลูปัสเป็นโรคที่มีความผิดปกติเกิดขึ้นกับอวัยวะเกือบทุกส่วนของร่างกาย อาการแสดงและความรุนแรงของโรคในผู้ป่วยแต่ละรายจะแตกต่างกันได้มาก นอกจากนี้ยาที่ใช้ในการรักษาโรคนี้โดยตรงส่วนใหญ่จะมีผลข้างเคียงค่อนข้างมาก ดังนั้นการวางแผนการรักษาสำหรับผู้ป่วยแต่ละรายจึงไม่สามารถกำหนดเป็นสูตรตายตัวลงไปได้ แต่ต้องพิจารณาเป็นราย ๆ ไป ผู้ป่วยรายใดจะใช้ยาอะไรในขนาดเท่าไร ขึ้นกับความสำคัญของอวัยวะที่เข้ามาเกี่ยวข้องและอาการแสดงในแต่ละวัน โดยต้องชั่งระหว่างผลดีกับผลเสียของการให้ยาตลอดเวลา
การรักษาโรคลูปัส แบ่งได้เป็น 2 ระยะ ระยะแรกเพื่อควบคุมการกำเริบของโรคให้สงบโดยเร็ว และระยะต่อไปเพื่อรักษาภาวะสงบไม่ให้โรคกลับกำเริบอีก